Nach abermaligen Erdbebenschäden 1201/02 wurde die Burg umfassend ausgebaut. Verstärkt wurde die Westseite der Kernburg und die dortigen Türme zu Rundtürmen ummantelt, der Talus als Erdbebenschutz errichtet und die äußere Zwingermauer erbaut. Die Südseite der Kernburg erhielt eine außergewöhnlich starke Befestigung. Drei gewaltige, nach außen abgerundete Türme wurden durch eine starke Mauer verbunden. Die Mauerstärke erreichte am mittleren Turm acht Meter. Bemerkenswert ist die handwerklich gute Steinmetzarbeit am Schnittpunkt zwischen Südmauer und Talus. Die Auffahrtsrampe zur Kernburg wird von einem fünfeckigen Turm aus großen Bossensteinen gesichert. Diese Neubauten wurden im Wesentlichen wahrscheinlich schon nach wenigen Jahren abgeschlossen. Der Bau der mit den Halbrundtürmen versehenen äußeren Zwingermauer erfolgte um 1250. Wahrscheinlich waren zum Zeitpunkt der mamlukischen Eroberung die Verteidigungselemente des Zwingers noch nicht vollständig errichtet. Im Inneren der Kernburg entstand – ebenfalls in der Mitte des 13. Jahrhunderts – der Saalbau. Er wurde im Stil der Hochgotik gestaltet und hat einen repräsentativen Charakter. Die Schmuckelemente sind auf französische oder auch antike Vorbilder zurückzuführen.

Ende als Kreuzritterburg

1267 griff Sultan Baibars erstmals den Krak des Chevaliers an und eroberte drei Burgen und 16 feste Türme in der Umgebung. 1271 kam es zu einer Belagerung der Burg, an der sich der Sultan ab dem 21. Februar persönlich beteiligte. Als Standort für die Bliden wählte man einen Bergvorsprung ca. 300 m von der Burg entfernt; heute befindet sich dort das Ausflugsrestaurant. Durch Beschuss wurden ein Turm an der Südwestecke und das heute nicht mehr vorhandene Vorwerk beschädigt. Das Vorwerk und eine Befestigungsanlage vor dem Osttor wurden durch das Heer des Sultans am 22. März eingenommen. Nach Unterminierung stürzte der Südwestturm des Zwingers ein und die Mamluken stürmten am 31. März den Zwinger. Die Johanniter zogen sich in die Kernburg zurück. Am 8. April 1271 ergaben sie sich – irregeführt durch einen gefälschten Brief – gegen die Zusicherung des freien Abzugs, die nicht eingehalten wurde.

Spätere Bauphasen

Entwicklung im 20. und 21. Jahrhundert

1921–1922 besuchte der Franzose Camille Enlart den Krak des Chevaliers. Auf ihn folgte 1926 der Architekt Maurice Pillet, der erste Einbauten entfernte. Am 16. November 1933 wurde das Bauwerk von Frankreich gekauft. Paul Deschamps (1888–1974), der sich am 11. April 1926 erstmals auf dem Krak aufgehalten hatte, veröffentlichte 1934 bei Geuthner in Paris sein Standardwerk Le Crac des Chevaliers. Étude historique et archéologique. Unter der Leitung von Pierre Coupel fanden 1934–1936 umfangreiche Restaurierungsarbeiten statt, dabei kam es zur Entfernung weiterer Einbauten aus osmanischer Zeit. In einem Staatsvertrag zwischen Frankreich und Syrien, einigten sich die beiden Länder am 7. Februar 1949 auf die Rückgabe. Die syrische Altertümer-verwaltung beauftragte darauf den Architekten Georges Kalamkarian mit den weiteren Restaurierungen

Syrischer Bürgerkrieg